針灸減肥刺激穴位，調節中樞神經系統功能，從而加速基礎代謝率，改善脂肪循環，產生熱量，消耗堆積的脂肪，達到減肥的目的。針灸減肥的副作用大多是醫生操作水平不達標造成的，但也可以通過有效的方法避免。但在臨床實踐中，常見的副作用有：針頭昏厥、傳染病感染、內臟損傷等。

微弱針昏迷

如果沒有效果，就會浪費錢，耽誤時間。但這還不算太可怕。更可怕的是“意外”。針灸減肥時，腹部的針不要扎得太深，否則會傷到內臟。尤其是對于一些腹壁比較薄的女性朋友，更要注意。針灸師要有處理一些異常現象的能力，如頭暈、針滯、斷針等。

傳染病

由于有些針灸場所沒有嚴格遵循“一人一針一穴”的基本原則，使用后立即丟棄，也沒有必要的消毒設備，導致這類針灸減肥的副作用。如果使用非一次性的針灸針，每次通過穴位時都要將針收好浸泡，然后高溫高壓消毒，防止傳染性病毒通過針傳播。

受傷的內臟

針刺不當常引起心肺等內臟損傷。銀針插入人體穴位后，也可能使毛細血管破裂。如果銀針在重復使用過程中沒有經過高溫高壓充分消毒，很容易傳播血液疾病。針灸減肥的專業要求很高。與其說針灸減肥是健康減肥，不如說嚴格規范的針灸減肥是健康減肥。